Un réservoir de SARS-CoV-2 découvert chez un animal indigène argentin

Les scientifiques du projet national ont découvert quatre spécimens infectés par la variante Gamma, trois mois après qu'aucun cas humain de ce sous-type du virus n'ait été enregistré.

Avril 2023
Un réservoir de SARS-CoV-2 découvert chez un animal indigène argentin

Des scientifiques du projet génomique interinstitutionnel argentin du SRAS-CoV-2, connu sous le nom de projet PAIS, ainsi que des chercheurs de l’Université nationale de La Pampa (UNLPam) et de l’Université de Buenos Aires (UBA), ont découvert une infection par la variante Gamma du SRAS. -CoV-2 dans quatre spécimens de tatous poilus en Argentine, ce qui postule que l’animal pourrait être un réservoir viral encore non identifié.

La prépublication, non encore évaluée par des pairs et publiée dans le référentiel BioRxiv , est basée sur le fait que la pandémie actuelle provoquée par le SRAS-CoV-2 et ses variantes représente un exemple du concept « One Health » dans lequel les humains et les animaux sont éléments d’une même chaîne épidémiologique.

« Les réservoirs animaux de ces virus font donc l’objet de programmes de surveillance pour suivre leur circulation et leur évolution dans des hôtes et réservoirs potentiellement nouveaux. Dans ce travail, nous rapportons la détection d’une infection par la variante Gamma du SRAS-CoV-2 dans quatre spécimens de Chaetophractus villosus (grand tatou poilu/tatou poilu) en Argentine », poursuit le texte.

« Outre la découverte d’une nouvelle espèce sauvage sensible à l’infection par le SARS-CoV-2, l’identification du variant Gamma trois mois après sa dernière détection chez l’homme est un résultat notable, qui pose la question des réservoirs possibles. infections virales non identifiées », concluait le résumé de la prépublication.

Comme détaillé sur le compte Twitter du Proyecto PAIS, « les quatre Peludos ont été retrouvés à General Pico, La Pampa, en mars 2022 ». Le diagnostic de COVID-19 a été posé et des anticorps neutralisants spécifiques contre le SRAS-CoV-2 ont été détectés. Ensuite, le génome complet du virus a été obtenu.

« Le résultat le plus surprenant est la découverte que ces animaux ont été infectés par la variante Gamma du SRAS-CoV-2, dont le dernier record de circulation, selon les rapports du GISAID, remonte au 10 janvier 2022 au Pérou et au 22 décembre 2022. , en Argentine », ont rapporté les scientifiques.

Ils ont précisé que la source la plus probable de l’épidémie survenue dans les installations de l’UNLPam, où les Peludos étaient en captivité, "n’a pas pu être déterminée", mais ils risquent qu’elle ait pu être générée par l’entrée d’autres animaux, tels que des rongeurs et des oiseaux. Cependant, tous les échantillons humains analysés au cours de la période correspondent au variant Ómicron.

"La découverte de cette espèce en tant qu’hôte sensible à l’infection par le SRAS-CoV-2 revêt une importance capitale en raison du transit croissant de cette espèce de la nature vers les zones peuplées", ont indiqué les scientifiques.

« Comment et où un variant supposément éteint a été maintenu et transmis à ces animaux reste un mystère », c’est pourquoi « l’intensification des programmes de surveillance est recommandée pour suivre la circulation et l’évolution du SARS-CoV-2 chez les hôtes et les réservoirs ». potentiellement nouveau », ont-ils conclu.